Amber11+AmberTools1.5+CUDA加速 安装总结

2017年02月05日 30 阅读

以下安装方法是根据分子模拟论坛网友的一些以前的帖子，进行了综合与总结，只要操作正确100%可以安装并测试成功。考虑到Amber11一般要安装在集群上使用，所以安装时采用intel的编译器，Openmpi并行器。Amber11软件需要购买获得使用license，AmberTools可以到www.ambermd.org免费下载。安装环境：Dell Precision Workstation T3400 à Q9550 8G ECC à...

Syncthing: 一个在计算机之间同步文件/文件夹的私密安全同步工具

2017年02月05日 29 阅读

简介Syncthing是一个免费开源的工具，它能在你的各个网络计算机间同步文件/文件夹。它不像其它的同步工具，如BitTorrent Sync和Dropbox那样，它的同步数据是直接从一个系统中直接传输到另一个系统的，并且它是完全开源的，安全且私密的。你所有的珍贵数据都会被存储在你的系统中，这样你就能对你的文件和文件夹拥有全面的控制权，没有任何的文件或文件夹会被存储在第三方系统中。此外，你有权决定这些数据该存于何处，是否要分享到第三方，或这些数据在互联网上...

如何管理 Vim 插件

2017年02月05日 28 阅读

Vim是Linux上一个轻量级的通用文本编辑器。虽然它开始时的学习曲线对于一般的Linux用户来说可能很困难，但比起它的好处，这些付出完全是值得的。vim 可以通过完全可定制的插件来增加越来越多的功能。但是，由于它的功能配置比较难，你需要花一些时间去了解它的插件系统，然后才能够有效地去个性化定置Vim。幸运的是，我们已经有一些工具能够使我们在使用Vim插件时更加轻松。而我日常所使用的就是Vundle。什么是VundleVundle意即Vim Bundle，...

一种基于Storm的可扩展即时数据处理架构思考

2017年02月05日 28 阅读

问题引入使用storm可以方便的构建一种集群式的数据框架，并通过定义topo来实现业务逻辑。但使用topo存在一个缺点， topo的处理能力来自于其启动时设置的worker数目，在很多情况下，我们需要能够根据业务压力来调整集群的处理能力，这时候单一的topo就无法解决这个问题了。为了能够更加灵活的定义处理能力，可以考虑将原有的topo根据业务域进行拆分，做到互不干扰，灵活控制，而且为了能够更加经济的利用处理资源，可以考虑引入worker资源池的概念，达到对...

Storm - 使用过程中的一点思考

2017年02月05日 27 阅读

引子这几天为了优化原有的数据处理框架，比较系统的学习了storm的一些内容，整理一下心得1. storm提供的是一种数据处理思想，它不提供具体的解决方案 storm的核心是topo的定义，而topo承载着所有的业务逻辑，我们基于storm的topo的组织方案，来编排私有的业务实现逻辑。 storm的业务抽象是最基本的信息流式处理范式。2. storm支持多种语言 storm提供的处理框架支持多种语言，java只是其中一种，我们可以使用不同的语言实现t...

Docker的常用命令说明

2017年02月05日 32 阅读

1、在daemon容器中如何和容器进行交互，因为貌似在daemon类型的容器中直接使用docker attache命令会直接死在那里，而不会出现容器的shell命令行，所以需要采用以下的方式：第一步：先查询容器，使用命令：docker ps，得到以下结果：CONTAINER ID IMAGE COMMAND CREATED STATUS PORTS NAMESa40...

Linux里命令的对话框whiptail

2017年02月05日 31 阅读

Linux里面可以在命令行里形成对话框，用光标上下，左右选择，一屏一屏的问答选择，填写。whiptail是Linux不需要另行安装，默认就有的，其它的比如dialog需要另行安装，很麻烦，虽然功能比较好些。帖一个写好的东西。#！/bin/bashtrap "" 2while truedoOPTION=$（whiptail --title "Email Manager" --nocancel --menu "Choose your option" 15 60...

CentOS里iptables的NAT

2017年02月05日 29 阅读

用CentOS 5.3配nat死活都不行，参考N多配置方法都无济于事。觉得是操作系统那里出了问题，又用了CentOS 6.6，里面有个配置的图形引导界面，很容易就搞定了。后来在英文网页里发现echo "1" > /proc/sys/net/ipv4/ip_forward这样就可以了。寻找N多地方，终于知道这是在OS系统默认不转发流量的时候，强制转发的方法。常态的让系统转发需要修改配置文件。/etc/sysctl.conf里面net.ipv4.ip_f...

VNC连接VMware vSphere ESXi5.5

2017年02月05日 27 阅读

开启VNC连接是针对guestOS的，要针对需要连接的guestOS机器进行编辑。首先要先把该机停止，然后对该机进行编辑，打开option，Advanced，general，Parameters点击进去。追加参数：RemoteDisplay.vnc.enabled TRUERemoteDisplay.vnc.port 5901RemoteDisplay.vnc.password 自己设定连接时候的密码RemoteDisplay.vnc.key...

Linux命令的类型

2017年02月05日 29 阅读

1.Linux内建命令: 由shell程序自带的命令，最常见的有cd、pwd等。使用type命令即可查看命令属于哪种，比如：#type cdcd is a shell builtin ————>看到这个提示的，说明此命令是内建命令2.Linux外部命令: 本身是一个独立的可执行程序文件，命令名即为程序文件名，常见的有ls、mv、ps等。查找方式：通过shell的内置的环境变量PATH中指定的路径进行查找...

history介绍及bash命令快速调用

2017年02月05日 29 阅读

在日常工作中，能够快速并准确的使用Linux命令是必不可少的，下面为大家介绍一下其中的小技巧。一、查找命令历史——history使用history能够快速的找到之前输入过的命令。# history大家可以看到，你输入过的命令会在列表中显现出来。前面是命令编号，有什么用？请看下方详解。额外选项：# history N 显示最近的N条命令，例如history 5# history -d N删除第N条命令，这个N就是前面的编号，例如h...

RAID1源代码分析

2017年02月05日 32 阅读

正确写流程的总体步骤是，raid1接收上层的写bio，申请一个r1_bio结构，将其中的所有bios[]指向该bio。假设盘阵中有N块盘。然后克隆N份上层的bio结构，并分别将每个bios[]指向克隆出来一个bio结构，然后进行相应设置。 对于没有Write Behind模式而言，之后将所有这些bios[]（共用页结构）放入队列pending_list中，对内存bitmap置位。接着由守护进程摘取pending_list链中的bio，然后将内存bitma...

构建一个Docker 的Java编译环境

2017年02月05日 33 阅读

用Dockerfile 构建一个Java的编译环境1、包括以下软件包Ubuntu jdk maven svn2、jdk、maven 需要手动下载，下载之后分别为jdk-8u51-linux-x64.gz apache-maven-3.3.3-bin.tar.gz3、创建一个Dockerfile文件，包含以下内容FROM ubuntuRUN apt-get updateRUN apt-get -y install subversionADD jdk-8u51...

UNIX文件权限之“设置用户ID位”

2017年02月05日 29 阅读

用stat函数可以获取一个文件的状态信息，原型是这样的：int stat（const char *path, struct stat *buf）;其中结构体stat的结构：struct stat { dev_t st_dev; /* ID of device containing file */ ino_t st_ino; /* inode number */ mode_t st_mode; /* protection *...

浅析 Linux/UNIX 信号机制

2017年02月05日 31 阅读

信号常常被称为“软中断”，和“中断”类似，用来通知程序发生异步事件。对信号的处理一般来说有三种方式：忽略，终止进程以及使用信号处理函数。信号处理函数的方式是从一处执行流断开，转而去运行另外的一处代码（信号处理），当处理函数返回时，继续从断开的地方继续执行。1、安装信号处理函数 在系统编程的层面上与信号的处理关系最直接相关的函数有两个，他们用来安装信号处理函数： sighandler_t signa...

使用xeCJK解决LaTeX中文问题的最小模板

2017年02月05日 33 阅读

LaTeX的中文支持一直是个问题，11年左右刚开始学习LaTeX的时候，那时的中文解决办法是CJK宏包。到了12年或13年的时候，再接触LaTeX的时候，LaTeX中文支持的最优解决办法变成了xeLaTeX+xeCJK，这大概是目前为止最优的中文解决方案。后来，CTEX学会将xeCJK的功能进行打包，发布了ctex宏包，进一步简化了用LaTeX写中文文档的问题。下面是利用xeLaTeX和 xeCJK实现中文支持的最小模板:12345documentclas...

Ubuntu 下安装 Texlive 并设置 CTeX 中文套装

2017年02月05日 29 阅读

Ubuntu 下安装 Texlive 并设置 CTeX 中文套装1 安装 texlive20131.1 下载 texlive2013下载地址:http://ftp.ctex.org/mirrors/CTAN/systems/texlive/Images/texlive2013-20130530.iso1.2 挂载 iso并安装texlive2013将下载的 texlive2013-20130530.iso 挂载到/mnt 目录下并运行 install-tl...

Linux下的GMT中文支持

2017年02月05日 30 阅读

原生GMT是不支持中文的，想要让GMT支持中文，需要进行一番配置。想要理解整个问题，需要对PostScript、CID字体有更深刻的理解，这未免有些过于复杂。所以这篇博文只介绍一些基本的原理，不一定准确但是却够用。修改配置这个事情本身不难，麻烦的是不同的发行版对ghostscript的打包方式不同，不同的ghostscript版本之间也会有一些差异。这里列出我在使用的系统信息，对于其他发行版以及gs版本，也有一些参考意义。操作系统：CentOS7.0gho...

Arch Linux 下的 QQ 解决方案

2017年02月05日 30 阅读

Linux 上面玩 QQ 一直都是一个问题。Wine 算是一个解决方案，但是也有不少人失败了。由于 QQ 的特殊性，采取了一系列的保护措施，导致 QQ 这个 Windows 程序非常复杂，因此 Wine 在运行 QQ 时表现差强人意。本文将要安装的是 QQ6.3 ，更高的版本除非对 QQ 做出修改，否则很难安装成功，即使成功了，问题也挺多的（笔者已试验过 QQ7.4 安装）。写这个的目的主要是方便有人遇到问题截图提问，毕竟 Linux 的普及工作还得靠大家...

Ubuntu 安装 TexLive2013 及中文支持

2017年02月05日 29 阅读

分享一下Ubuntu 安装配置 TexLive2013 及中文支持经验。1、材料准备texlive的安装包：可以百度下，这里也提供一个下载地址: http://mirror.hust.edu.cn/CTAN/systems/texlive/Images/texlive2013-20130530.iso ,这个是来自华中科技大学的镜像。相关中文字体下载:------------------------------------------分割线--------...